Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rfx2P48379 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rfx2P48379 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms