Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VdrP48281 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VdrP48281 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VdrP48281 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms