Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gbx2P48031 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx2P48031 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms