Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrprbP47758 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms