Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cdkn1bP46414 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cdkn1bP46414 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms