Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klf1P46099 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klf1P46099 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms