Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syt1P46096 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms