Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nkx2-6P43688 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nkx2-6P43688 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms