Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ItgavP43406 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ItgavP43406 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms