Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdx2P43241 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdx2P43241 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms