Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkx1-2P42580 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkx1-2P42580 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms