Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Mmp9P41245 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Mmp9P41245 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Mmp9P41245 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Mmp9P41245 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Mmp9P41245 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
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