Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd9P40240 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd9P40240 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd9P40240 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd9P40240 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms