Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms