Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lig1P37913 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lig1P37913 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms