Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PpargP37238 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms