Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KdrP35918 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KdrP35918 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KdrP35918 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KdrP35918 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KdrP35918 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KdrP35918 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KdrP35918 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdrP35918 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdrP35918 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdrP35918 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KdrP35918 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KdrP35918 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KdrP35918 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KdrP35918 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdrP35918 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdrP35918 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdrP35918 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KdrP35918 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms