Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PtprkP35822 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PtprkP35822 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms