Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ptpn1P35821 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ptpn1P35821 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms