Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ercc5P35689 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms