Protein–RNA interactions for Protein: P35546

Ret, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, mousemouse

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetP35546 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RetP35546 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RetP35546 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RetP35546 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RetP35546 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RetP35546 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms