Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Grin1P35438 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms