Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TpoP35419 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TpoP35419 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TpoP35419 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TpoP35419 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TpoP35419 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TpoP35419 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TpoP35419 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TpoP35419 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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TpoP35419 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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