Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PpardP35396 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PpardP35396 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpardP35396 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpardP35396 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpardP35396 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpardP35396 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PpardP35396 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PpardP35396 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PpardP35396 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PpardP35396 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms