Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rab20P35295 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rab20P35295 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms