Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdh15P33146 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms