Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd28P31041 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
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