Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sstr1P30873 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms