Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk4P30285 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk4P30285 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms