Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msr1P30204 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms