Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtprmP28828 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtprmP28828 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtprmP28828 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PtprmP28828 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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