Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RxrgP28705 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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