Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxd10P28359 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxd10P28359 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms