Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa2P28309 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms