Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gjb3P28231 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms