Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vav1P27870 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vav1P27870 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vav1P27870 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms