Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CenpbP27790 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms