Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lef1P27782 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms