Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pde6aP27664 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pde6aP27664 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms