Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PdgfraP26618 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PdgfraP26618 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms