Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra3P26049 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms