Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms