Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cd247P24161 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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