Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm38250-202ENSMUST00000195108 462 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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Hoxd11P23813 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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Hoxd11P23813 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm44936-201ENSMUST00000207324 735 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms