Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Eif3aP23116 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Eif3aP23116 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms