Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou3f1P21952 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pou3f1P21952 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms