Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SftpcP21841 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms