Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxb9P20615 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxb9P20615 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms