Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ifrd1P19182 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms