Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tnnc1P19123 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tnnc1P19123 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms